Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh13Q9WTR5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms