Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms