Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubd1Q9R1K7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms