Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chst4Q9R1I1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chst4Q9R1I1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chst4Q9R1I1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chst4Q9R1I1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chst4Q9R1I1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chst4Q9R1I1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms