Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr54Q9R0D8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms