Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nek3Q9R0A5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms