Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col4a3Q9QZS0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms