Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpc1Q9QZF2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc1Q9QZF2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc1Q9QZF2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc1Q9QZF2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc1Q9QZF2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc1Q9QZF2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc1Q9QZF2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc1Q9QZF2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpc1Q9QZF2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc1Q9QZF2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpc1Q9QZF2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms