Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc3Q9QZC1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms