Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vps29Q9QZ88 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps29Q9QZ88 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms