Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubxn8Q9QZ49 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms