Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rdh11Q9QYF1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rdh11Q9QYF1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh11Q9QYF1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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