Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd4Q9QY39 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd4Q9QY39 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms