Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxe3Q9QY14 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms