Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2e3Q9QXZ7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2e3Q9QXZ7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms