Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms