Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Limd1Q9QXD8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms