Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyhr1Q9QXA1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyhr1Q9QXA1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyhr1Q9QXA1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms