Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PdcQ9QW08 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms