Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms