Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms