Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col5a3Q9JLI2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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