Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gde1Q9JL56 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms