Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bace2Q9JL18 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms