Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot9Q9JKY0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot9Q9JKY0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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