Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms