Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrac1Q9JKP8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms