Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx6Q9JKK1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Stx6Q9JKK1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms