Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nectin1Q9JKF6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms