Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tuba8Q9JJZ2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tuba8Q9JJZ2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Tuba8Q9JJZ2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Tuba8Q9JJZ2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Tuba8Q9JJZ2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Tuba8Q9JJZ2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Tuba8Q9JJZ2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Tuba8Q9JJZ2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Tuba8Q9JJZ2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Tuba8Q9JJZ2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Tuba8Q9JJZ2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tuba8Q9JJZ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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