Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Bco1Q9JJS6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bco1Q9JJS6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Bco1Q9JJS6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bco1Q9JJS6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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