Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ59

Abcb9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb9Q9JJ59 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb9Q9JJ59 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb9Q9JJ59 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb9Q9JJ59 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb9Q9JJ59 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb9Q9JJ59 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb9Q9JJ59 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb9Q9JJ59 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb9Q9JJ59 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb9Q9JJ59 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb9Q9JJ59 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb9Q9JJ59 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcb9Q9JJ59 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcb9Q9JJ59 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms