Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmbr1Q9JIT0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmbr1Q9JIT0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms