Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnmb4Q9JIN6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Kcnmb4Q9JIN6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Kcnmb4Q9JIN6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Kcnmb4Q9JIN6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Kcnmb4Q9JIN6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Kcnmb4Q9JIN6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Kcnmb4Q9JIN6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Kcnmb4Q9JIN6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Kcnmb4Q9JIN6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnmb4Q9JIN6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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