Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc22Q9JIG7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms