Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClpxQ9JHS4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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