Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms