Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn19Q9ET38 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms