Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim2Q9ESN6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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