Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hapln2Q9ESM3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hapln2Q9ESM3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms