Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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