Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms