Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms