Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hipk3Q9ERH7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms