Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms