Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf1Q9DBU0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms