Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpraQ9DBG7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpraQ9DBG7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms