Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop5Q9DB28 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop5Q9DB28 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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