Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ift43Q9DA69 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift43Q9DA69 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms