Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmco5aQ9D9D5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmco5aQ9D9D5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms